1. 行業(yè)

生物反應器廣泛應用于食品、農(nóng)業(yè)、畜牧業(yè)、漁業(yè)和化學工業(yè)等行業(yè)。該設(shè)備應用于醫(yī)藥、診斷服務和分析等領(lǐng)域，以及資源能源和生物電子學領(lǐng)域。

例如，在食品制造中，通過使大豆、大米和果汁與曲霉和酵母發(fā)生反應來生產(chǎn)味噌、醬油、清酒、葡萄酒等的方法可以被視為一種生物反應器。一個典型的工業(yè)例子是通過固定化酶（使其可重復使用）來大量生產(chǎn)氨基酸、糖等。

此外，在研究和醫(yī)學領(lǐng)域，可以利用細胞培養(yǎng)來產(chǎn)生細胞內(nèi)的功能物質(zhì)，然后可以提取作為藥用物質(zhì)。

2. 物理化學

生物反應器也用于檢測和量化物理化學物質(zhì)。自動分析儀使用固定化酶來光學跟蹤化學反應，并可連續(xù)分析許多樣本。

生物傳感器是一種通過電追蹤反應的方法。具體例子包括酶傳感器、微生物傳感器和半導體生物傳感器。